Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SERP1Q9Y6X1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms