Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL42Q9Y6G3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL42Q9Y6G3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms