Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms