Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF1Q9Y548 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF1Q9Y548 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms