Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLXND1Q9Y4D7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms