Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms