Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZDHHC9Q9Y397 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms