Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAB39Q9Y376 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAB39Q9Y376 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms