Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG6Q9Y2V7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms