Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAN1Q9Y2M0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAN1Q9Y2M0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms