Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM2AQ9Y2K7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM2AQ9Y2K7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms