Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC47.93■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.9■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC47.89■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NISCHQ9Y2I1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC47.87■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC47.86■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
NISCHQ9Y2I1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms