Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS2Q9Y248 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms