Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1024Q9UPX6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1024Q9UPX6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms