Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF9BQ9UPX0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF9BQ9UPX0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms