Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGTPBP1Q9UPW5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGTPBP1Q9UPW5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms