Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms