Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX12Q9UMY4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX12Q9UMY4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms