Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms