Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms