Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
STAG3Q9UJ98 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
STAG3Q9UJ98 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms