Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms