Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHORDC1Q9UHD1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms