Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms