Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms