Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV2

SEL1L, Protein sel-1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1LQ9UBV2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEL1LQ9UBV2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEL1LQ9UBV2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms