Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms