Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MBD5Q9P267 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
MBD5Q9P267 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
MBD5Q9P267 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms