Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC88CQ9P219 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms