Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms