Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SH3BP4Q9P0V3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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