Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms