Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX43Q9NXZ2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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