Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms