Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms