Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B1Q9NRF2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms