Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms