Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRDM8Q9NQV8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms