Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms