Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms