Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABCB9Q9NP78 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms