Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL44Q9H9J2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL44Q9H9J2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms