Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCBP2Q9H190 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCBP2Q9H190 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms