Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH6AQ9H0K4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH6AQ9H0K4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms