Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms