Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms