Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP44Q9H0E7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms