Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms