Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms