Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIH1Q9BYX4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIH1Q9BYX4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIH1Q9BYX4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIH1Q9BYX4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIH1Q9BYX4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms